Ekstyrpacja (łac. extirpatio, czyli wykorzenienie), to zabieg operacyjny polegający na usunięciu danego narządu w całości. W stomatologii ekstyrpacja stanowi jedną z metod leczenia kanałowego, obok dewitalizacji. Jest to metoda znacznie bardziej humanitarna od dewitalizacji, która polegała na zatruwaniu miazgi poprzez zastosowanie pasty chemicznej, zawierającej paraformaldehyd. Metoda ekstyrpacji przyżyciowej polega natomiast na całkowitym usunięciu zainfekowanej miazgi z kanałów i komory, które odbywa się podczas pierwszej wizyty w gabinecie dentystycznym. Zabieg wykonywany jest w znieczuleniu miejscowym. Dzięki zastosowaniu ekstyrpacji podczas jednej wizyty można z powodzeniem przejść do dalszych czynności związanych z leczeniem kanałów – ich opracowania i wypełnienia. Etap dewitalizacji jest pominięty.